Szombathely rendszerváltást követő első polgármestere két cikluson keresztül, 1998-ig viselte hivatalát. ‘98 és 2000 között a Berzsenyi Dániel Főiskola tanára volt. Közreműködésével jött létre többek között a Claudius Ipari Park, valamint a Korai Fejlesztő Központ, de szerepet vállalt a Szombathely-Kőszeg szennyvízcsatorna fejlesztésében és a helyi szennyvíztisztító kapacitásának bővítésében is. Wagner András 54 éves korában, 2007. május 31-én hunyt el, autóbaleset következtében. Sírjánál fejet hajtottak Szombathely korábbi és jelenlegi vezetői, valamint Wagner András családtagjai is. Koszorúval és egy szál fehér rózsával rótták le kegyeletüket a nyughelynél.
